NIPT bepaalt enkel het aantal chromosomen 21, 18, 13, alsook het geslacht.
Kleine afwijkingen (deleties of duplicaties) van deze chromosomen, mosaicisme voor deze 3 chromosomen, andere chromosoomafwijkingen, en molekulaire monogene afwijkingen (Mucoviscidose, kanker, etc) worden niet opgespoord met NIPT.
